НИР по теме: «Адаптация и совершенствование биоинформатических и программных алгоритмов отбора антигенов-мишеней для разработки мРНК-вакцин при терапии опухолей с низкой мутационной нагрузкой»

До окончания подачи заявок — 2 дн 9 ч

Номер:
0373100043226000210
Закон:
44-ФЗ
Способ:
Электронный аукцион
Статус:
Подача заявок
Регион:
Москва
НМЦК:
135 333 333,23 ₽
Приём заявок до:
22.10.2026

Что закупают

  • 1-й этап Адаптация алгоритмов Системы для поиска неоантигенов в расширенных классах геномных и транскриптомных событий при пониженной мутационной нагрузке опухоли1.00000000000 Условная единица
  • 1.2 Адаптация Системы для возможности запуска в тестовом режиме на Kubernetes1.00000000000 Условная единица
  • 1-й этап Исследование существующих методов предсказания тройного взаимодействия «пептид – MHC – TCR»1.00000000000 Условная единица
  • 1-й этап Развертка и тестирование Систему на инфраструктуре Заказчика (по итогам 1 этапа)1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Исследования подходов к анализу репертуаров TCR / BCR, включая сборку полных VDJ-последовательностей TCR (α- и β-цепей) и BCR (тяжёлых и лёгких цепей), идентификацию CDR3-регионов, определение V/(D)/J-сегментов, оценку клональности (распределение по размерам клонов, индексы Шеннона, Симпсона, Gini), идентификацию экспансивных клонов; поиск совпадений CDR3-последовательностей с базами VDJdb, IEDB, McPAS-TCR.1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Разработка экспериментального образца Системы, включающий модуль предиктивной модели иммунного распознавания «пептид–MHC–TCR» на языке Nextflow1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Расширение области поиска неоантигенов и углубленная оптимизация модулей аннотации1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Проведение исследования подходов к анализу гетерогенности опухоли для нескольких регионов опухоли по данным секвенирования1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Исследование предсказания связывания и презентации антигенов через неклассические молекулы MHC класса Ib1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Исследование кросс-реактивности неоантигенов с референсным иммунопептидомом и нецелевого эффекта1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Доработка модуля формирования регистра пациентов, получающих лечение мРНК-вакцинами1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Доработка клинико-диагностического дашборда1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Расширение поиска неоантигенов в дополнительных классах геномных и транскриптомных событий1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Исследование подходов к формированию персонализированной ctDNA-панели для мониторинга минимальной остаточной болезни (MRD)1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Доработка Системы по результатам тестирования программного конвейера на симулированных и открытых данных, в том числе методов предсказания тройного взаимодействия «пептид – MHC – TCR»1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Разработка и адаптация программных и биоинформатических алгоритмов Системы для работы с данными секвенирования длинных прочтений РНК/кДНК для поиска неоантигенов.1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Проведение углубленного исследования и разработка интегрированной мультимодальной модели взаимодействия «пептид – MHC – TCR» для высокоточной предсказательной оценки иммунного распознавания неоэпитопов Т-клеточными рецепторами.1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Проведение исследования подходов к расширению репертуара кандидатных неоантигенов за счет событий аденозин-в-инозинового редактирования РНК (A-в-I редактирования РНК)1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Проведение исследования подходов к учету метаболического состояния опухоли, ассоциированного с иммуносупрессией и нарушением презентации антигенов, при отборе и приоритизации неоантигенов1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Подготовка списка ранжированных неоантигенов и конкатемеры на экспериментальных данных Заказчика1.00000000000 Условная единица
  • 2-й этап Развертка и тестирование Системы на инфраструктуре Заказчика (по итогам 2 этапа), включая доработку поддержки Kubernetes1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Расширение функционала Системы для работы с данными секвенирования длинных прочтений РНК/кДНК для поиска неоантигенов1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Разработка модуля идентификации третичных лимфоидных структур (TLS)1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Исследование модуля деконволюции с использованием данных секвенирования единичных клеток1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Проведение исследования подходов к мониторингу T-клеточного ответа1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Расширение функциональности регистра по учёту результатов других типов анализа, реализуемых на различных этапах данного Контракта1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Подготовка рекомендаций по дальнейшему развитию программного конвейера и финальная доработка ПО1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Исследование и развитие методов предсказания тройного взаимодействия «пептид – MHC – TCR»1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Исследование подходов к предикции тяжёлых нежелательных явлений1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Исследование подходов к априорной оценке риска тяжёлых НЯ на уровне кандидатных эпитопов1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Доработка модуля многокритериальной фильтрации и приоритизации неоантигенов1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Получения списка ранжированных неоантигенов и конкатемеры на экспериментальных данных Заказчика1.00000000000 Условная единица
  • 3-й этап Развертка и тестирование Системы на инфраструктуре Заказчика (по итогам 3 этапа)1.00000000000 Условная единица

Документы

  • Приложение № 1 - Описание объекта закупки — Описание объекта закупки
  • Приложение № 2 - Обоснование НМЦК — Обоснование начальной (максимальной) цены контракта
  • Приложение № 3 - Требования к содержанию, составу заявки, инстр по запол. — Требование к содержанию, составу заявки на участие в закупке
  • Приложение № 4 - Проект контракта — Проект контракта
  • Приложение № 5 - Дополнительная информация к извещению — Дополнительная информация и документы

Не читать документацию целиком

ИИ-разбор пройдёт по 5 файлам этой закупки и соберёт требования, сроки и риски в один отчёт.

Другие закупки этого заказчика